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空中响起奇怪的声音，人们一个接一个地倒下，并最终消失。出现在前往调查的精英部队GUTS-SELECT队员们面前的是，一波波来袭的外星人军团，以及驾驶着漆黑要赛艇“佐尔加乌斯”的支配者基贝尔斯教授，它妄图扭曲地球的天空。
奏大等人陷入苦战，这时，一个神秘的女性从天而降，她似乎知道基贝尔斯的事情。拥有着不可思议力量的女人名叫蒂娜丝。她与GUTS-SELECT队员们合作，以守护的使命迎战邪恶的阴谋。
然而，天上的银河终究还是扭曲，“皇兽”的凶暴身姿降临了。赌上地球和宇宙的生死存亡，奏大、蒂娜丝、GUTS-SELECT展开了总决战！
真選組魔鬼副長——土方十四郎的身邊來了一個名叫佐佐木鐵之助的二打六。
這位鐵之助雖然來自幕府中菁英輩出的名門——佐佐木家，卻是個眾人束手無策的問題兒童，被各署踢嫌棄，最後被送來了真選組。
面對態度輕浮的鐵之助，土方雖然感到煩躁，卻還是努力保持理智，一直照顧他。就在某一天，遇見了在警察當中算是集結了眾多菁英的組織「見迴組」的局長——佐佐木異三郎。異三郎是鐵之助同父異母的哥哥，卻藐視鐵之助，叫他「不成材」或「二房之子」。
土方聽了動怒，直接挑釁異三郎。
因為他將找不到容身之處的鐵之助，與曾經是無可救藥的自己重疊在一起。
鐵之助得知了土方的過去，洗心革面，下定決心要以土方為目標，變得更強。
土方託付他幫忙寄送重要的信件，鐵之助全力要完成任務，卻在路途上被激進攘夷集團——知惠空黨綁架了。
他們的目的是抓走與警察有關係的鐵之助，當作人質，一口氣擊垮真選組與見迴組。
然而見迴組毫不理會人質，擊潰知惠空黨，甚至還企圖將責任全推到託付了鐵之助的真選組。
知道他是為了將知惠空黨一網打盡，將自己的弟弟當作道具利用，使土方激動不已…
真選組與見迴組即將爆發全面戰爭！！
